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| Data de publicação | Data de apresentação | Título | Autor(es) | Orientador(es) | Coorientador(es) |
| 12-Dez-2023 | 14-Fev-2023 | Alinhamento paralelo de sequências biológicas com poda agilizada em GPU | Pinho, Matheus Augusto Silva | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 14-Fev-2024 | 15-Out-2021 | Análise bioinformática de miRNAs putativos em sequências de kDNA de Trypanosoma cruzi integradas no genoma humano | Marques, Marina Dias | Hecht, Mariana Machado | - |
| 5-Nov-2025 | 10-Fev-2025 | Atualização do uso de memória de GPU na ferramenta MASA-CUDAlign de comparação de sequências biológicas longas | Aragão, Rafael Rodrigues Gamas Domingos de | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 15-Out-2021 | 9-Jul-2019 | Avaliação de estratégias Alignment-free para determinar o fator de pruning em comparação paralela de sequências | Cunha, Rafael Neiva da | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 7-Ago-2017 | 20-Dez-2016 | Avaliação de Interação Humano-Computador : um estudo de caso para Bioinformática | Esteves, Gabriella de Oliveira | Walter, Maria Emilia Machado Telles | - |
| 6-Out-2023 | 24-Fev-2023 | Classificação de RNA telomerase usando extração de características e técnicas de aprendizado de máquina | Alvarez, Ana Luísa Salvador | Walter, Maria Emilia Machado Telles | - |
| 29-Jul-2016 | 2016 | Classificação de RNAs não-codificadores longos intergênicos usando máquina de vetores de suporte : um estudo de caso para a cana-de-açúcar | Vieira, Lucas Maciel | Walter, Maria Emilia Machado Telles | - |
| 10-Nov-2022 | 4-Nov-2021 | Cloudificação de aplicações multi-GPU de bioinformática no AWS ParallelCluster da nuvem Amazon | Soares, Filipe Maia | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 8-Ago-2017 | 3-Fev-2017 | Comparação de sequências biológicas longas em FPGA usando particionamento | Silveira, Andressa Sousa da | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 30-Mai-2016 | Fev-2016 | Comparação de sequências biológicas utilizando a plataforma XD2000i de hardware reconfigurável | Colletti, Marcelo Ramos | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 21-Dez-2017 | 3-Jul-2017 | Comparação paralela de múltiplos pares de sequências biológicas em GPU e CPU com work stealing | Marques, Thiago Costa; Silva, Willian Picinato da | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 8-Out-2014 | 21-Ago-2014 | Compressão de sequências de DNA usando codificação de vídeo | Alves, Jaime Cândido Dourado | Zaghetto, Alexandre | - |
| 29-Set-2016 | 11-Jul-2016 | Disk-Assited Parallel A* : estratégia de movimentação de dados memória-disco para o alinhamento múltiplo ótimo de sequências | Razzolini, Cainã F. B. | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 5-Abr-2018 | 11-Dez-2017 | Estratégias paralelas para alinhamento de sequências biológicas em espaço linear com algoritmo Myers-Miller em CPU | Gomes, Eduardo Monteiro de Castro | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 13-Mai-2024 | 18-Dez-2023 | MAPA : módulo assíncrono para aceleração de poda da ferramenta CUDAlign | Nascimento, Matheus Trajano do | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 25-Mai-2021 | 1-Set-2020 | MASA-Webaligner : uma plataforma web para execução e visualização de alinhamentos de sequências de DNA | Nascimento, Bernardo Costa | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 30-Abr-2019 | 6-Jul-2018 | Mecanismo de parada síncrona para comparação paralela de sequências biológicas longas em ambientes heterogêneos | Nanami, Eduardo Shindi; Oliveira, Jadiel Teófilo Amorim de | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 11-Ago-2020 | 19-Abr-2018 | Método para predição de potenciais alvos de microRNA em flavivírus emergentes | Valadares, Andressa | Machado, Maria Emília Walter Telles | Raiol, Tainá |
| 6-Jun-2017 | 1-Jun-2016 | NoSQL Cassandra : um estudo de caso com workflows de bioinformática | Oliveira, Matheus Moreira Marques de | Holanda, Maristela Terto de | - |
| 15-Ago-2016 | 15-Dez-2015 | Proveniência de dados de workflows de bioinformática usando o banco de dados no SQL ArangoDB | Sousa, Bruno Aires de | Holanda, Maristela Terto de | - |
