Implementação de protótipo de um SMA para anotação manual em projetos de sequenciamento de genomas

Abstract

Atualmente, existe um grande volume de dados contendo informações biológicas que estão disponíveis na Web. Os biólogos usam tais informações para inferir funções de genes que são descobertos e estudados em projetos de seqüenciamento de genomas. Esta tarefa constitui a fase de anotação destes projetos. Ferramentas computacionais podem auxiliar os biólogos a completarem esta tarefa com uma maior acurácia e em menor tempo. O objetivo do nosso trabalho é disponibilizar aos biólogos sugestões de funções de genes, que podem apoiar a anotação manual em projetos genômicos usando técnicas de Inteligência Artificial. Particularmente, este trabalho propõe um sistema colaborativo usando a abordagem de Sistemas Multiagente, baseado em fonte de dados genômicos integrados, heterogêneos e autonômos disponíveis na Web. O sistema provê a combinação de diferentes agentes com ontologias específicas. Estes agentes devem interagir e fornecer como resultado uma sugestão de anotação que deve ser posteriormente avaliada e validada pelos biólogos. Utilizando este sistema apresentamos um estudo de caso comparando os resultados produzidos pelo nosso Sistema comas anotaçõesmanuais já completadas no Projeto Genoma Paracoccidioides brasiliensis, realizado pela Rede Genoma Centro-Oeste.