Prospecção de Enzimas do Complexo CRISPR/Cas a partir do Microbioma Intestinal do Cumpim Syntermes wheeleri

Abstract

O sequenciamento metagenômico em plataforma NGS Illumina da microbiota intestinal do cupim Syntermes wheeleri permitiu, além do aprofundamento na compreensão do seu nicho ecológico, a prospecção de produtos biotecnológicos. Esse trabalho soma-se aos esforços na prospecção e caracterização de enzimas de interesse biotecnológico, tendo como objetivo prospectar enzimas do complexo CRISPR/Cas a partir de dados metagenômicos da microbiota intestinal do cupim Syntermes wheeleri. As sequências metagenômicas da microbiota associada ao cupim Syntermes wheeleri serão analisadas para a identificação de enzimas associadas ao complexo CRISPR/Cas de edição gênica. A seleção das enzimas de interesse ocorreu a partir de sistema de busca pelo nome de cada enzima em banco de dados ggKbase (https://ggkbase.berkeley.edu/). As sequências obtidas foram avaliadas quanto à qualidade seguindo parâmetros de completude, tamanho e similaridade com bancos de dados de proteínas caracterizadas experimentalmente. Ao todo foram obtidas 288 enzimas do complexo CRISPR/Cas no banco de dados do microbioma intestinal de Syntermes wheeleri. Dessas, 127 apresentavam códon de início e parada da tradução. O tamanho de 110 enzimas foi compatível com o tamanho de proteínas já caracterizadas experimentalmente. No total, 105 sequências apresentaram ao menos uma sequência de AA com identidade no banco de dados PDB. Ao final, foram selecionadas 66 proteínas que tem potencial para futuras sínteses por expressão heteróloga e caracterização estrutural e enzimática.