Análise de perfil de metilação de genoma completo em câncer colorretal

Abstract

Introdução: O câncer colorretal (CCR) é um dos tipos de câncer que mais afeta homens e mulheres no Brasil. Estudos prévios já identificaram diversos genes associados ao CCR. O processo de metilação envolve modificações químicas que podem causar alteração na expressão gênica. Este trabalho teve por objetivo a análise de perfil de metilação de genoma completo para a identificação de posições (DMPs) e regiões diferencialmente metiladas (DMRs) entre indivíduos com e sem câncer colorretal. Metodologia: Foram comparados dados de metilação de indivíduos com câncer colorretal (n = 4) e controles saudáveis (n = 4) utilizando-se o chip Infinium MethylationEPIC BeadChip (EPIC), que mede níveis de metilação em mais de 886 mil probes. Procedimentos de controle de qualidade e de normalização pelos métodos Funnorm e Relic foram realizados. Resultados: Foram identificadas 111 DMRs, contendo 58 genes distintos, dos quais GPSM2, LOC647121, RUNX3 e IGFBP3 foram previamente identificados como prognósticos de câncer colorretal, além de outros genes biomarcadores de CCR e de genes que possuem relação com supressão de tumor. Conclusão: Mesmo com amostras pequenas, foi possível se identificar muitos genes em regiões diferencialmente metiladas. Mais estudos são necessários para confirmação de tais resultados e melhor entendimento das funções desses genes no desenvolvimento e progressão de CCR.