Um novo capilovírus em Copaifera langsdorffii Desf. (Copaíba) no Brasil central

Abstract

O Cerrado brasileiro possui uma grande diversidade de espécies e um gênero popularmente conhecido é Copaifera (família Fabaceae). Copaifera tem como representantes espécies arbóreas que apresentam grande importância econômica, e ocorrem em alta frequência, não apenas no Bioma Cerrado, mas também em todos os outros biomas brasileiros. As espécies de copaíba são utilizadas para obtenção dos produtos madeireiros e não madeireiros. Nas indústrias cosmética e farmacêutica o óleo de copaíba por apresentar ação anti-inflamatória, antimicrobiana e antitumoral, vem ganhando espaço no mercado interno e apresenta, uma crescente demanda de exportações. A copaíba assim como outras espécies arbóreas, podem funcionar como nicho ecológico de diversos microrganismos, inclusive vírus. Características peculiares dos vírus como tamanho pequeno e pouca diversidade morfológica, dificultam sua detecção em espécies arbóreas, principalmente em ambientes naturais. Estima-se que menos de 1% da diversidade viral seja conhecida. Entretanto nos últimos anos, o surgimento de novas tecnologias moleculares aliadas a bioinformática e sequenciamento de alto rendimento, contribuíram para o avanço na descoberta e descrição de novos microrganismos incluindo vírus de plantas. Neste contexto, considerando a diversidade viral, pouco explorada, em espécies arbóreas de ambientes nativos do Brasil e a disponibilidade de informações em repositórios públicos, um levantamento inicial, exaustivo e minucioso de SRA, permitiu a obtenção de um genoma viral parcial em transcriptoma de Copaifera langsdorffi Desf. Posteriormente com o auxílio de softwares de bioinformática o genoma completo foi recuperado e as ORF’s foram devidamente anotadas. Após análises filogenéticas e de predição taxonômica, utilizando critérios de demarcação de novas espécies estabelecidas pelo Comitê Internacional de Taxonomia de Vírus (ICTV), concluiu-se que o genoma obtido corresponde a uma nova espécie, denominada copaifera langsdorffii-associated virus 1 (CLaV1) para o gênero Capillovirus e família Betaflexiviridae. Este é o primeiro relato de um vírus em copaíba.