| Título: | Uma extensão do ncRNA-Agents : um estudo de caso para o gênero Oryza do reino Plantae |
| Autor(es): | Andrade, Rafael B |
| Orientador(es): | Walter, Maria Emilia Machado Telles |
| Assunto: | RNAs não-codificadores
Bioinformática
Sistema multiagente
Biologia computacional |
| Data de apresentação: | 2015 |
| Data de publicação: | 28-Jul-2016 |
| Referência: | ANDRADE, Rafael B. Uma extensão do ncRNA-Agents: um estudo de caso para o gênero Oryza do reino Plantae. 2015. xii, 226 f., il. Monografia (Bacharelado em Engenharia da Computação)—Universidade de Brasília, Brasília, 2015. |
| Resumo: | Neste trabalho, criamos uma nova instância do ncRNA-Agents, um sistema de anotação
de RNAs não-codificadores (ncRNAs) baseado em sistemas multiagentes. Nesta versão,
o usuário pode anotar ncRNAs de plantas, usando sequências de cDNA dos organismos
Oryza barthii, Oryza brachyantha, Oryza glaberrima, Oryza glumaepatula, Oryza longistaminata,
Oryza meridionalis, Oryza nivara, Oryza punctata, Oryza rufipogon e Oryza
sativa Indica. Além disso, foi incluído o software snoReport para anotar snoRNAs (C/D
box e H/ACA box), um tipo específico de ncRNA. Por fim desenvolvemos um estudo de
caso para a espécieOryza sativa Japonica. |
| Abstract: | In this work, we create a new instance of ncRNA-Agents, an annotation system of noncoding
RNA’s (ncRNA’s) based on multiagent systems. In this version, the user can annotate
plant ncRNAs using the sequences of cDNA of Oryza barthii Oryza brachyantha,
Oryza glaberrima, Oryza glumaepatula,Oryza longistaminata, Oryza meridionalis, Oryza
nivara, Oryza punctata, Oryza rufipogon and Oryza sativa Indica as reference. Furthermore,
the software snoReport was included to annotate snoRNAs (C/D and box H/ACA
box), a specific type of order ncRNA. Finally, we developed a case study for the species
Oryza sativa Japonica. |
| Informações adicionais: | Monografia (graduação)—Universidade de Brasília, Instituto de Exatas, Departamento de Ciência da Computação, 2015. |
| Aparece na Coleção: | Engenharia da Computação
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